Optimasi Konsentrasi Agar-Agar Food Grade Sebagai Pengganti Gel Agarose Pada Deteksi Pita DNA Escherichia coli

Siti Julianti, Dea and Nur Indra, Asep Iin and Merdekawati, Fusvita and Khoirul Abror, Yogi (2026) Optimasi Konsentrasi Agar-Agar Food Grade Sebagai Pengganti Gel Agarose Pada Deteksi Pita DNA Escherichia coli. Diploma thesis, Politeknik Kesehatan Kemenkes Bandung.

[thumbnail of COVER.pdf]
Preview
Text
COVER.pdf

Download (155kB) | Preview
[thumbnail of LEMBAR PENGESAHAN_KTI.pdf]
Preview
Text
LEMBAR PENGESAHAN_KTI.pdf

Download (513kB) | Preview
[thumbnail of LEMBAR PERSETUJUAN.pdf]
Preview
Text
LEMBAR PERSETUJUAN.pdf

Download (276kB) | Preview
[thumbnail of Abstrak.pdf]
Preview
Text
Abstrak.pdf

Download (169kB) | Preview
[thumbnail of Daftar Isi.pdf]
Preview
Text
Daftar Isi.pdf

Download (236kB) | Preview
[thumbnail of BAB 1.pdf]
Preview
Text
BAB 1.pdf

Download (146kB) | Preview
[thumbnail of BAB 2.pdf] Text
BAB 2.pdf
Restricted to Repository staff only

Download (562kB)
[thumbnail of BAB 3.pdf] Text
BAB 3.pdf
Restricted to Repository staff only

Download (285kB)
[thumbnail of BAB 4.pdf] Text
BAB 4.pdf
Restricted to Repository staff only

Download (420kB)
[thumbnail of BAB 5.pdf]
Preview
Text
BAB 5.pdf

Download (129kB) | Preview
[thumbnail of DAFTAR PUSTAKA.pdf]
Preview
Text
DAFTAR PUSTAKA.pdf

Download (119kB) | Preview
[thumbnail of Surat Pernyataan Publikasii.pdf]
Preview
Text
Surat Pernyataan Publikasii.pdf

Download (420kB) | Preview

Abstract

Elektroforesis gel DNA merupakan metode yang banyak digunakan dalam analisis biologi molekuler untuk memisahkan fragmen DNA. Agarose sebagai media gel standar memiliki keterbatasan berupa harga mahal dan ketergantungan pada produk impor, sehingga menjadi kendala bagi laboratorium pendidikan. Agar-agar Food Grade yang berasal dari alga merah (Rhodophyta) berpotensi sebagai alternatif yang lebih ekonomis karena memiliki kemampuan membentuk gel. Penelitian ini bertujuan menentukan konsentrasi optimal agar-agar Food Grade sebagai pengganti gel Agarose dalam elektroforesis DNA Escherichia coli. Penelitian menggunakan desain eksperimental semu (quasi experiment) dengan pendekatan kuantitatif dan Rancangan Acak Lengkap (RAL). DNA Escherichia coli diisolasi menggunakan metode spin column, kemudian gen 16S rRNA diamplifikasi melalui PCR menghasilkan fragmen target 584 bp. Elektroforesis dilakukan menggunakan variasi konsentrasi agar-agar Food Grade 0,5%; 1%; 1,5%; dan 2%, dengan Agarose 1,5% sebagai kontrol pembanding, masing-masing diulang tiga kali. Pita DNA divisualisasikan menggunakan UV Transilluminator dan dianalisis secara densitometri menggunakan perangkat lunak ImageJ. Pita DNA target 584 bp hanya terdeteksi pada konsentrasi 0,5% dan 1%, sedangkan konsentrasi 1,5% dan 2% tidak menghasilkan pita yang terdeteksi. Rata-rata luas area pita DNA tertinggi diperoleh pada konsentrasi 0,5% sebesar 55.028,83 pixel², diikuti konsentrasi 1% sebesar 49.235,02 pixel², keduanya di bawah kontrol Agarose 1,5% sebesar 61.095,94 pixel². Konsentrasi 0,5% ditetapkan sebagai konsentrasi optimum. Agar-agar Food Grade direkomendasikan sebagai alternatif media elektroforesis DNA yang lebih ekonomis untuk kegiatan praktikum di laboratorium pendidikan, dengan disertai optimasi lanjutan berupa penggunaan Buffer sodium borate, penyesuaian tegangan dan waktu running, serta pengujian konsentrasi di bawah 0,5% sebelum diterapkan pada laboratorium klinik.

Kata Kunci: agar-agar Food Grade, Agarose, elektroforesis DNA, Escherichia coli, optimasi konsentrasi

Item Type: Thesis (Diploma)
Subjects: 600 Teknologi dan Ilmu-ilmu Terapan > 610 - 619 Ilmu Kedokteran dan Ilmu Pengobatan > 610 Ilmu Kedokteran, Ilmu Pengobatan dan Ilmu Kesehatan
600 Teknologi dan Ilmu-ilmu Terapan > 610 - 619 Ilmu Kedokteran dan Ilmu Pengobatan > 611 Anatomi Manusia, Biologi Sel, Biologi Jaringan
Divisions: Jurusan Teknik Laboratorium Medik > DIII
Depositing User: Miss DEA SITI JULIANTI
Date Deposited: 24 Aug 2026 06:46
Last Modified: 24 Aug 2026 06:46
URI: http://repo.poltekkesbandung.ac.id/id/eprint/19265

Actions (login required)

View Item View Item