Modifikasi Isolasi DNA Metode Boiling untuk Identifikasi Gen nuc pada Bakteri Staphylococcus aureus Menggunakan PCR Konvensiona

Jati, Arum and Merdekawati, Fusvita and Nur Indra, Asep Iin and Rosyati, Oos Fatimah (2026) Modifikasi Isolasi DNA Metode Boiling untuk Identifikasi Gen nuc pada Bakteri Staphylococcus aureus Menggunakan PCR Konvensiona. Diploma thesis, Poltekkes Kemenkes Bandung.

Preview	Text COVER.pdf Download (54kB) | Preview
Preview	Text LEMBAR PENGESAHAN.pdf Download (103kB) | Preview
Preview	Text LEMBAR PERSETUJUAN.pdf Download (90kB) | Preview
Preview	Text ABSTRAK.pdf Download (41kB) | Preview
Preview	Text DAFTAR ISI.pdf Download (45kB) | Preview
Preview	Text BAB I.pdf Download (109kB) | Preview
	Text BAB II.pdf Restricted to Repository staff only Download (621kB)
	Text BAB III.pdf Restricted to Repository staff only Download (210kB)
	Text BAB IV.pdf Restricted to Repository staff only Download (137kB)
Preview	Text BAB V.pdf Download (37kB) | Preview
Preview	Text DAFTAR PUSTAKA.pdf Download (139kB) | Preview
Preview	Text Surat Pernyataan Publikasi Ilmiah.pdf Download (106kB) | Preview

Abstract

Identifikasi Staphylococcus aureus secara molekuler memerlukan isolasi DNA yang berkualitas sebagai tahap awal. Metode boiling merupakan metode sederhana dan ekonomis, namun kurang optimal untuk bakteri Gram positif seperti Staphylococcus aureus akibat lapisan peptidoglikan yang tebal. Modifikasi dengan penambahan enzim lisozim diharapkan dapat meningkatkan efektivitas lisis sel sehingga menghasilkan DNA yang memadai untuk amplifikasi PCR.
Penelitian ini bertujuan untuk menentukan konsentrasi enzim lisozim yang optimal dalam modifikasi isolasi DNA metode boiling untuk identifikasi Staphylococcus
aureus serta mengevaluasi kemampuan DNA hasil isolasi dalam mengamplifikasi
gen nuc melalui PCR konvensional.
Hasil penelitian menunjukkan bahwa penambahan lisozim menurunkan kemurnian
DNA dibandingkan kontrol (A260/A280 kontrol 1,23; lisozim 10 mg/mL 1,09; 20 mg/mL 098; 25 mg/mL 0,89), akibat pelepasan komponen seluler non-DNA yang
lebih banyak tanpa tahap pemurnian. Konsentrasi DNA tertinggi diperoleh pada
perlakuan 25 mg/mL (125,8 ng/µL). Seluruh perlakuan berhasil mengamplifikasi gen nuc dengan pita DNA pada ukuran sekitar 270 bp. Intensitas pita DNA tertinggi berdasarkan nilai integrated density ImageJ diperoleh pada perlakuan lisozim 10 mg/mL (32.877.430), diikuti 25 mg/mL (26.846.874) dan 20 mg/mL (26.671.238), sedangkan kontrol hanya 6.157.995.
Konsentrasi enzim lisozim yang optimal adalah 10 mg/mL, karena menghasilkan keseimbangan terbaik antara efektivitas lisis dan minimnya pengotor yang menghambat PCR. Disarankan untuk melakukan tahap pemurnian DNA (purifikasi) setelah isolasi metode boiling serta membandingkan metode boiling yang dimodifikasi dengan lisozim terhadap metode isolasi DNA lain yang memiliki tahap pemurnian untuk memperoleh DNA dengan kualitas yang lebih baik untuk pemeriksaan PCR.

Kata Kunci: Staphylococcus aureus, isolasi DNA, metode boiling, lisozim, PCR
konvensional, gen nuc

Item Type:	Thesis (Diploma)
Subjects:	600 Teknologi dan Ilmu-ilmu Terapan > 610 - 619 Ilmu Kedokteran dan Ilmu Pengobatan
Divisions:	Jurusan Teknik Laboratorium Medik > DIII
Depositing User:	Miss ARUM LISTYANI MULIA JATI
Date Deposited:	19 Aug 2026 07:45
Last Modified:	19 Aug 2026 07:45
URI:	http://repo.poltekkesbandung.ac.id/id/eprint/18901

Actions (login required)

View Item